Topologia chromatyny: przełomowe badania z udziałem Instytutu Nenckiego

Grupa badaczy z Instytutu Nenckiego wzięła udział w nowatorskim programie badań dotyczącym przestrzennej topologii chromatyny w jądrze komórkowym i jej wpływie na transkrypcje genów. Wyniki tej pracy zostały opublikowane w wiodącym czasopiśmie biologicznym Cell dnia 17 grudnia 2015 roku.

Cały opisywany cykl badań był koordynowany przez grupę Prof. Yijuna Ruana z Jackson Laboratories w Farmington w Stanach Zjednoczonych. Amerykańska grupa wykorzystała zaawansowaną technikę sekwencjonowania ChIA-PET (ang. Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag sequencing) aby zobrazować strukturę chromatyny wyższego rzędu w czasie interfazy podziału komórkowego. Rolą naukowców z Instytutu Nenckiego było potwierdzenie otrzymanych wyników za pomocą niezależnych metod morfologicznych takich jak wysokorozdzielcza mikroskopia czy technika FRET/FLIM. Stworzenie modelu ludzkiego genomu 3D umożliwia określenie osobniczych różnic w ekspresji ludzkich genów i podstawy do badania mechanizmu wielu chorób.

Tang Z, Luo OJ, Li X, Zheng M, Zhu JJ, Szalaj P, Trzaskoma P, Magalska A, Wlodarczyk J, Ruszczycki B, Michalski P, Piecuch E, Wang P, Wang D, Tian SZ, Penrad-Mobayed M, Sachs LM, Ruan X, Wei CL, Liu ET, Wilczynski GM, Plewczynski D, Li G, Ruan Y. (2015) CTCF-Mediated Human 3D Genome Architecture Reveals Chromatin Topology for Transcription. Cell. 2015 Dec 17;163(7):1611-27.